Prof. Kočandrle byl vůdčí osobností československé transplantační medicíny. V roce 1966 se podílel na první úspěšné transplantaci ledviny v IKEM (tehdejší ÚKECH) a v roce 1983 i na první úspěšné transplantaci srdce v bývalých socialistických zemích. Až do roku 1990 vedl Institut klinické a experimentální medicíny. Později pracoval ve vojenském Walter Reed Medical Center ve Washingtonu.
V roce 1994 se vrátil zpět, aby vedl plánované kardiocentrum Ústřední vojenské nemocnice, které nakonec realizováno nebylo. V roce 2000 byl oceněn za svůj přínos k rozvoji české transplantační medicíny Výroční cenou České transplantační nadace (K. Pavlíka). S Vladimírem Kočandrlem odchází kus historie české medicíny.
